En lang krig er over og det galaktiske imperiet har vokst, men det er ikke stabilt. Opprørsgrupper kjemper fortsatt mot regimet, men med oppfinnelsen av genetisk transformasjon kan en normal sivilist transformeres til en tankeløs, lett å kommandere, men sterk kampenhet. Disse sivile ble ikke spurt, de ble tvunget til å gjennomgå prosedyren. Du spiller en av disse sivile. Først tok de datteren din og så kom de etter deg. Men før prosedyren ble fullført, ble du reddet av opprørerne. Nå er det din tur til å kjempe tilbake.