En klok ninja ved navn NIN-JA står opp for å redde prinsesse SAKURA som ble kidnappet av den onde ninjaen NAMAKURA. Bli den største ninjamesteren i verden i Adventure Mode ved å fly fritt med hopp- og kjedehandlinger for å klare alle 50 scener mens du følger scenariet, og i Score Attack Mode ved å fortsette å angripe fiender som dukker opp etter hverandre. Et høyhastighets skyggespill, NIN2-JUMP presentert av CAVE Company, begynner endelig her! Din støtte gir ham energi, så vær så snill å støtte ham!