Spillingen i Sexy Parodius ligner på resten av serien, men med en ny fangst. I stedet for å bare spille gjennom hvert nivå og ødelegge fiender samtidig som han unngår å bli truffet, må spilleren også fullføre et spesielt oppdrag for hvert trinn. Noen av disse oppdragene spenner fra å samle inn en viss mengde mynter i et stadium til å ødelegge en bestemt gjenstand eller fiender. Avhengig av om spilleren fullfører eller ikke, vil oppdraget avgjøre om spilleren kan fortsette til neste trinn eller hva neste trinn vil være. I motsetning til tidligere versjoner, har hjemmeportene i spillet (unntatt PSP-versjonen) samarbeidende flerspiller intakt (der begge spillerne spiller samtidig). Det er også forbedret ved at spillet fortsetter å spille selv når en spiller velger en karakter ved å fortsette. I et 2-spillers spill, når visse karakterer er nær nok, dukker det opp et tredje skudd mellom dem, som kan være lilla skudd som virvler over hele skjermen, hjerter som går mot fiender, eller raketter som skyter rett frem. Denne funksjonen ble først sett på Konamis arkadespill Trigon. De spillbare karakterene i dette spillet er: Vic Viper/Lord British Michael/Gabriel Hikaru/Akane Ivan/Toby Mambo/Samba Koitsu/Aitsu Option/Multiple Shooting Star/Black Viper