Keio Flying Squadron 2 ble utgitt i 1996 for Sega Saturn i Japan, Europa og Australia. Den andre delen av serien fortsetter historien om Ramis eventyr som Keeper of the Secret Treasure (en sfære som er gått i arv gjennom generasjoner av Ramis familie). Rami raser mot Dr. Pon og en ny rival Himiko Yamatai for en eldgammel skatt som kan låses opp med seks kuler. To av stadiene beholder shoot-em-up-stilen til det første spillet, men de mindre dragene kan kun fås som bonuser. Hovedsakelig består etappene av sidescrolling-plattformer-etapper. Disse ruller fra høyre til venstre på den japanske versjonen og fra venstre til høyre på alle andre versjoner. Flere bonuser kan samles, inkludert tre våpen (Rami kan også sprette på hodene til fiender for å beseire dem): En stor klubbe, kun brukt til å treffe fiender En paraply, som brukes til å treffe fiender, flyte og avlede hindringer over hodet En bue, som brukes til å skyte piler mot fiender. Foruten plattformspillet og skytespilletrinnene, er det vertikalt rullende spesialtrinn, en undervannsscene og en berg-og-dal-bane, noe som gjør spillet til en multisjangerplattform. Poengsfærer kan samles gjennom hele spillet. Et belønningssystem fra hovedmenyen låste opp nyttige hint og ekstramateriale bak kulissene avhengig av høyeste og laveste poengsum oppnådd gjennom å spille.