Historien om Christmas Nights følger Elliot og Claris i høytiden etter deres eventyr med Nights. Selv om de begge nyter julesesongen, føler de at noe mangler. Når de oppdager at julestjernen som vanligvis sitter på toppen av Twin Seeds-juletreet mangler, drar de til Nightopia for å finne den. Der møter de Nights igjen og utforsker Spring Valley, som nå har blitt julefestet på grunn av barnas drømmer om høytiden. Trioen av helter må nå ta ned en gjenopplivet Gillwing og hente julestjernen fra hulen hans. Spillet bruker Saturns interne klokke for å endre elementer i spillet i henhold til dato og klokkeslett. I november og januar endres tittelskjermetiketten "Nights: Limited Edition" til "Winter Nights", med det frodige grøntområdet i miljøet som erstattes av hvit snø. I løpet av desember aktiveres "Christmas Nights"-modusen, noe som resulterer i ytterligere endringer med juletema, som for eksempel gjenstandsbokser som blir julegaver, Nightopians kler seg i alvekostymer og juletrær som erstatter Ideya-fangst. Bakgrunnsmusikken er erstattet av en instrumental versjon av "Jingle Bells", i tillegg til at det er en "juleaktig" gjengivelse av sjefstemaet. I løpet av "Winter Nights"-perioden vil været i Spring Valley endre seg etter hvilken time det er. Andre kosmetiske endringer er synlige på nyttårsdag, og innlasting av spillet på aprilsnarr resulterer i at Reala erstatter Nights som den spillbare karakteren.