Spilleren overtar kontroll over tre separate skip som drives av tre separate piloter: Alpha Ship er pilotert av Yugo Tyrone, Beta Ship blir pilotert av Belle Vogato, og Gamma Ship blir pilotert av Kenny Crawford (selv om ingen av pilotenes navn er nevnt i spillet). Hvert skip har et forskjellig avfyringsmønster, og alle tre av dem kombinert sammen når skipene er dannet sammen som månedykkeren; deres oppgave er å slå ned en romveseninvasjon som strekker seg over hele Melkeveien, og ødelegge romvesenets hovedkvarter: Danger-Seed. Spilleren starter spillet med tre separate jagerfly og må komme seg gjennom fire rør ved å bruke jagerflyene hver for seg; hvis det ene blir ødelagt, gjør det neste, kraftigere skipet et forsøk på å komme seg gjennom. Hvis spilleren kommer til det femte trinnet, kombineres de tre skipene til et enkelt komposittskip kalt "Moon Diver", som har en enorm mengde ildkraft - og hvert skip har skjold, men etappene må fullføres med ett skip