Hovedpersonen, Kenji, bor sammen med sin adopterte søster Yuki, som beundrer hennes eldre bror og har en liten hemmelig forelskelse i ham. En dag, etter en bestemt natt, begynner en jente - Hiyori, deres barndomsvenn - å dukke opp i Kenjis skap. Dessuten er kroppen hennes gjennomsiktig, og hun har hull i hukommelsen. Mens de sliter med å finne ut av mysteriet bak Hiyoris tilstand, begynner Kenji å innse de glemte følelsene hans og Yuki lider med hemmeligheten hennes.