I Android Assault har en fremmed art kalt Xias målrettet mennesker for utryddelse. De har samlet en massiv flåte som har knust ethvert motstridende skip som har blitt sendt deres vei og har begynt å angripe kolonier stasjonert på nærliggende planeter med kollisjonskurs mot jorden, og det er opp til spilleren å stoppe dem. Spillet er et siderullende skytespill, likt R-Type, der spilleren tar kontroll over en romjager som kan forvandles til en cyborg kalt Bari-Arm og har et arsenal av våpen for å ta ned fiendtlige skip inkludert Thundercracker, Burning Wave og Chase Cannon sammen med å plukke opp helse og ødelagte fiender som er etterlatt.