Toy Soldiers: War Chest ligner på de tidligere spillene der spillere hindrer fiendtlige enheter fra å nå lekeboksen ved å bygge og oppgradere tårn. I War Chest kan tårn forbedres ved å oppgradere rustning, brannhastighet og skade separat. Fiendens AI er også forbedret. For eksempel vil ødeleggelse av en bro føre til at bakkeenheter tar en annen vei til lekeboksen. Enkelte enheter har evnen til å helbrede enheter i nærheten, og noen vil fokusere på å ødelegge eventuelle plasserte tårn. Barrages og spillbare enheter fra Toy Soldiers: Cold War kommer tilbake med noen få endringer. I stedet for å tjene killstreaks eller ødelegge en spesielt merket fiendtlig enhet, bruker spillet en bar som fylles opp når du dreper fiendtlige enheter. Når stangen er fylt til en viss mengde, kan en spesiell evne brukes til å kalle inn sperringer eller gyte en helteenhet som en zeppelin som utfører en bombing. Spillet har 4 svært tilpassbare hærer (8 i Hall of Fame Edition). Spillere kan velge hvilke tårn som skal utplasseres, sperre og modifisere heltens arsenal. Etter hvert som spillet skrider frem, vil nye tilpasningsalternativer bli tilgjengelige. Hall of Fame Edition har fire ekstra lisensierte hærer basert på fiktive karakterer. Dette inkluderer Duke og Cobra Commander fra G.I. Joe, Ezio Auditore da Firenze fra Assassin's Creed og He-Man fra Masters of the Universe. Karakterene kan kjøpes separat eller som en pakke på standardversjonen.