Hovedkampspillet beskrives best som et polygonalt Marvel vs. Capcom-spill, med noen bemerkelsesverdige forskjeller. Kontrollmessig varierer spillet fra andre Capcom-kampspill ved å bare ha fire knapper (to slag og to spark, som er nærmere SNK-spillformatet) i stedet for standard seks. En spiller velger et lag med to karakterer, og kjemper mot et annet lag med to karakterer. Selve kampene er imidlertid en-til-en-kamper, der partneren bare deltar ved å bli kalt inn når en spiller har nok "kraft" til et Team Up-angrep, utført ved å trykke på en slag- og sparkknapp med samme trykk. Team Ups ville være et slags dobbeltlagsangrep fra karakteren og partneren, eller (for de fleste kvinnelige karakterers Team Ups) ville helbrede hovedpersonen eller gi dem mer kraft. Etter slutten av en runde har en spiller (vinne eller tape) et valg om å kjempe neste runde med partneren fra forrige runde, eller å beholde hovedpersonen i spill. "Vigor"-måleren (i hovedsak en supermåler) kan gå opp til 9 nivåer, med Team Ups som koster to nivåer og supertrekk fra en enkelt person som alle koster ett kraftnivå. På samme måte som Marvel vs. Capcom-spillene, kan lanseringer gjøres som gjør det mulig å utføre luftkombinasjoner, med alle karakterer som har universelle lav- og høyutskytere. Kampen hadde også noen få forsvarsteknikker. Tardy Counters oppførte seg omtrent som Alpha Counters fra Street Fighter Alpha, slik at en spiller umiddelbart kunne angripe fra en blokkerende posisjon. Restriksjonene på Tardy Counters er imidlertid svært slappe; ethvert hardt normalt, spesielt eller superangrep kan brukes til å motvirke Tardy (Alfa-tellere er bare begrenset til visse spesialbevegelser for hver karakter), og Tardy-tellere koster ikke noe ekstra kraft å utføre (Alpha-tellere krever minst et nivå av Super Combo-måler for å gjøre). Angrepsavbrytelser tillot en spiller å kansellere et innkommende treff ganske enkelt ved å tidsbestemme sitt eget treff med angrepet, noe som ville kansellere begge angrepene (selv om det ikke annullerer de gjenværende treffene i et flertreffstrekk). I tillegg tildeles ett ekstra kraftnivå.