Det er starten på en ny tidsalder, og Bonk har kommet tilbake ved tidevannets sving når verden står overfor utryddelse. Vår elskelige hulemann er tilbake og har tatt med seg det enorme hodet sitt. En dommedagskomet, omgitt av mindre biter av rusk, er på kollisjonskurs med jorden. Et merkelig magnetfelt rundt kometen ser ut til å drive de fleste av planetens viljesvake skapninger til vanvidd, og mindre biter av rusk knuser inn i jungelen nær Bonks hjem. Bonk må foreta en farefull reise som vil ta ham til planetens sentrum for å redde verden.