I Endonesia tar spilleren rollen som en gutt som gikk inn i parken og plutselig befant seg i en annen verden. En mystisk stemme kontakter ham og sier at denne verden heter Endonesia, og hvis han vil reise hjem, må han påkalle dens femti guder. For å finne gudene må helten kommunisere med innbyggerne i Endnesia ved å overføre sine egne følelser til andre. Laget av Taro Kudo og Kazuyuki Kurashima av Love-de-lic berømmelse, er Endnesia en av de åndelige etterkommerne (sammen med Giftpia og Chulip) av deres banebrytende spill Moon: Remix RPG Adventure. Som de andre spillene, er Endnesia et gåteløsende eventyr med rollespillelementer som statistikk, gjenstandsinnsamling og karaktervekst. Temaet for spillet er å dele følelser; Spillmessig oversettes det til gåteløsning som innebærer å bruke de riktige følelsene på de riktige karakterene til rett tid. For eksempel, å bruke sultfølelsen på et dyr vil gjøre det sultent, og oppfordre det til å finne mat, noe som vil rydde veien for helten. På samme måte som Moon og dens etterkommere har Endnesia en dag-natt-syklus. Heltens helsemåler er oppbrukt på grunn av utmattelse; Selv om spillets verden er ganske stor, har spilleren alltid en tidsbegrensning for sine daglige aktiviteter. Spilleren bør også mate helten; sult gjør synet hans uklart og bremser tempoet.