Covert Command er et enspiller tredjepersons skytespill satt under andre verdenskrig. I spillet vil spilleren ta på seg rollen som en uerfaren soldat som sendes til slagmarken. Tilbudene totalt tretti oppdrag som vanligvis involverer å drepe alle fiender, ødelegge et bestemt mål eller fullføre oppdraget på en fastsatt tid. Terrenget spenner fra byer til jungel. Mens du spiller kan spilleren bruke granater og våpen for å drepe fiendene. I tillegg kan ammunisjon og våpen noen ganger gjenvinnes fra de drepte fiendene.