NCAA FINAL FOUR '99 tilbyr tre spillmoduser: utstilling, turnering og en sesong med 30 spill. Reglene kan konfigureres til dine preferanser, enten det er arkade eller simulering. Dette påvirker hvilke feil som blir kalt og avgjør om spillerne dine føler effekten av tretthet eller ikke. Du kan også velge mellom en rekke kontrollerkonfigurasjoner, vanskelighetsinnstillinger, spilllengder og kameravinkler for å endre spillet. Og selvfølgelig er alt gjengitt i 3D, noe som skaper følelsen av at du er midt i handlingen. Det er 250 divisjon I-lag tilgjengelig, noe som gjør det enkelt å finne favorittlaget ditt på listen. Lyden, som inkluderer play-by-play-kommentarer, balldunk og sneaker-knirking, fungerer bra for å få deg oppmuntret og involvert i spillet. Du kan også spille med opptil åtte venner (med et multitap) i flerspillerspillet.