Metamor Panic: Doki Doki Yōma Busters!! er et visuelt eventyrspill i romanstil med RPG-elementer. Eventyrscenene går for det meste lineært, med spilleren av og til bedt om å velge en handling, for eksempel å velge hvilket emne han skal spørre en karakter om, eller å undersøke et bestemt objekt. Kampsekvenser vil også av og til forekomme, som tar et standard turbasert JRPG-format der de tre karakterene kjemper mot yōkai. Spillet bruker ikke bare tilbehøret til et rollespill for smak; det inkluderer nivåer opp, karakterstatistikk og varehåndtering, og i motsetning til mange spill i denne stilen, er det muligheten for å tape kamper som fører til at spillet er over.