I år 2050, 10 år etter "Sharon Apple"-hendelsen på Eden (Macross Plus), ble den fredelige atmosfæren i en koloni i dypt rom knust av en gruppe terrorister. U.N Spacy-regjeringen bestemte seg for å sende inn spesialstyrken "VF-X Ravens"-skvadronen for å beskytte kolonien. En skremmende ny enhet har nettopp blitt utviklet...En som kan vippe kampskalaen til fordel for siden som kontrollerer den. Denne nye enheten ble opprettet av "Critical Path Corporation", under ordre fra deres president, "Manfred Brando". Enheten har evnen til å blokkere alle våpensystemer, noe som gjør dem helt ubrukelige. Terrorgruppen som angrep koloniene er kjent som "Black Ravens", ledet av deres fryktløse leder "Timoshie Daldahnton"...Kodenavnet "All Kill Wizard". Målet deres er å styre galaksen, og det eneste som står i veien for dem er den samlede styrken til FNs Spacy-styrker. Denne nye enheten kan endre det... Som Ace Pilot, "Aegis Focker", er det opp til deg og VFX Ravens "Alpha Squadron", å forsvare kolonistene fra terroristene og stoppe dem fra å bruke enheten til å utslette FN-styrkene. Du vil få styre de mest avanserte Variable Fighters i FNs arsenal, og fly inn i faren med vingmennene dine rett ved siden av deg. Ting er imidlertid ikke som de ser ut...Det er en forræder blant rekkene, en som sympatiserer med terroristene, og har en egen skjult agenda...Hvem kan det være? Den eneste måten å finne ut av det på er å spille gjennom hele spillet!, det er noen få viktige hendelser som vil dukke opp i løpet av oppdragene dine, der handlingsvalget ditt bestemmer veien historien vil ta og hva slags slutt du får. Kan du redde kolonistene, være lojal mot vennene dine, beseire terroristene og stoppe SDF-makrossen på en gang?...alt avhenger av veien du velger... Du kan se Galleri 1 - Galleri CG-bilder fra åpningskinoen og et galleri 2 -Ulåst etter å ha fullført spillet én gang, Flere CG-bilder av Valkyrie-kjemperne og en video av BGV-bakgrunnen... Låst opp etter å ha fullført spillet én gang, Det er tre Variable Fighter-moduser: 1.) Fighter - Din standard Jet-Fighter-konfigurasjon. Brukes primært til luftkamp. 2.) Konfigurasjon av Battroid Mech (Giant Robot). Brukes primært til bakkeoppdrag, eller mekanikk for å mekanisere kamper i luften. Denne modusen lar deg bare bruke våpnene dine som et våpen. 3.) Gerwalk - Ground effektiv forsterkning av bevinget bevæpning med lokomotiv kneledd. Denne modusen er i utgangspunktet en hybrid av en jetjager og en mek. Den opprettholder utseendet til en jetfly, men thrusterne blir til bena og peker nedover slik at de kan sveve i luften. Brukes til bakkeoppdrag og kamper i lav høyde, hvor det trengs både missiler og våpen. Spillet er delt i 12 oppdrag og ble kun utgitt i Japan.