Cartoon Networks guttegeni Dexter prøver å redde laboratoriet sitt fra arkivet Mandark i Dexter's Laboratory: Mandark's Lab? Mandark har infiltrert Dexters laboratorium og omprogrammert datamaskinen hans, så spillerne må hjelpe Dexter å vinne den tilbake ved å fullføre dette eventyrspillet som dekker fire områder som består av Dexters hus og laboratoriet hans. I hvert område er det to minispill og fire skjulte blåkopibrikker til en av Dexters oppfinnelser som gir ham en fordel i hvert av minispillene. Både Dee Dee's Dance Off, som har spillere som trykker på knapper i takt til musikk, og Cootie Call der Dexter utrydder flygende cootie-feil, finner sted på soverommet til Dee Dee. What's Buggin' Dexter, et kappløp mellom Dexter og en feil som potensielt kan infisere datamaskinen hans, finner sted i datamaskinens kretskort, og Dexters Dodgeball finner sted i skolegården med Dexter som målretter skolebøller med lekeplassballer.