Darius Gaiden er en todimensjonal shoot'em up. Spilleren kontrollerer et romskip som heter Silver Hawk og må lede det gjennom rullestadier, ødelegge fiender og unngå hindringer underveis. Skipet er bevæpnet med foroverskytende missiler, luftbomber og et beskyttende kraftfelt, som alle kan oppgraderes med forskjellige power-ups som slippes av spesielt fargede fiender når de blir ødelagt av spilleren. Nytt i Silver Hawks arsenal i Darius Gaiden er "svarthullsbomben". Når den blir avfyrt, vil svarthullsbomben skape en stor virvel i midten av skjermen, som suger inn fiender og prosjektiler på skjermen et kort øyeblikk, til den eksploderer til en kraftig lynkule som påfører alle fiender på skjermen massiv skade. En annen funksjon introdusert Darius Gaiden er muligheten til å fange minibosser, som dukker opp i alle stadier. Hver miniboss har en liten, sirkulær ball plassert på seg som, etter å ha mottatt nok skade, vil løsne og flyte bort, noe som får minibossen til å gå på tomgang. Hvis spilleren samler ballen, vil minisjefen følge etter og hjelpe spilleren. Etter en kort periode, eller spilleren mister et liv, vil minibossen eksplodere. Noen måneder etter utgivelsen ble oppdateringen til arkadeversjonen senere utgitt med tittelen "Darius Gaiden Extra Edition". Denne versjonen av arkadespillet inneholder omorganiserte nivåer, samt automatisk aktivert automatisk brann, to ekstra våpenstyrkenivåer (større bølgeskudd og et større rødt bølgeskudd også) og en modus for alle trinn som kan nås ved å starte spillet på 2P-siden.