Fragile Dreams finner sted etter en apokalyptisk hendelse som utslettet det meste av menneskeheten. Unge Seto finner en lapp fra sin avdøde bestefar som oppfordrer ham til å reise til det røde tårnet som lyser opp nattehimmelen. Underveis finner han en ung, sølvhåret jente Ren som driver ham til å reise gjennom den ødelagte verdenen på jakt etter vennskap. Fragile Dreams: Farewell Ruins of the Moon er et action-eventyrspill med lette RPG-elementer og fokus på å utforske de ofte øde omgivelsene. Spillerne har i oppgave å navigere i de tomme miljøene mens de kjemper mot spøkelser og får tak i gjenstander som skisser og noveller som avslører de siste øyeblikkene i livene til de som ble tapt i den store katastrofen. Seto blir guidet gjennom et tredjepersonsperspektiv og lommelykten er et av hans viktigste hjelpemidler. Kontrollert gjennom Wii-fjernkontrollen lyser den opp mørke omgivelser for å samhandle med miljøet og er nødvendig for å løse mange gåter. Den kan også avdekke skjulte fiender og ofte gir en lyd gjennom minihøyttaleren et hint om deres plassering. Nunchucken brukes til å gå, snike seg rundt og huke seg. Det er mulig å gå inn i et førstepersonsperspektiv for å få et bedre syn på miljøet. Ytterligere våpen som kan plukkes opp i løpet av spillet er pinner, et jernrør, en bue, en hammer, et bambussverd og en katana.