Spillet er satt på den fiktive Suthon Island. Det sies å ha makten til å beskytte verden mot skade, som den ble beskyttet av et stort palmetre og overvåket av naturåndene på øya. Før spillet tar antagonisten, Omminus, over øya for å styre verden. Som et resultat begynner palmetreet å visne og prinsessen blir syk. Lederen for naturåndene minner om en gammel legende om en helt som bruker hellige perler for å gjenopprette freden. Han finner skattekisten der helten Zip bor. Zip, og en venn fra naboøya Eesturn, Pip, satte ut for å hente perlene og beseire Omminus.