Denne oppfølgeren til Battalion Wars er omtrent som forgjengeren, og blander sanntidsstrategi med tredjepersons skyting. Spillets handling sporer tiår med krig blant seks fraksjoner (Solar Empire, Western Frontier, Anglo Isles, Iron Legion, Tundran Territories, Xylvania), og utfolder seg gjennom moderne oppdrag som fremmer konflikten og flashback-oppdrag som avslører historien. Spillere kontrollerer en soldat eller et land-, sjø- eller luftkjøretøy for å delta i kamp direkte og for å kommandere andre enheter. Wii-fjernkontrollen brukes til å målrette og skyte, men valg og bestilling av enheter utføres gjennom konvensjonelle knappetrykk. Wii Nunchuks thumbstick kontrollerer spillerens bevegelser, og unnvikende manøvrer håndteres gjennom bevegelser. I enkeltspillerkampanjemodus overtar spilleren kontroll over de forskjellige fraksjonene på forskjellige punkter i konfliktens historie. Spillet har også tre online flerspillermoduser. Skirmish-modus er en tidsbestemt to-spillers kamp for å score flere poeng enn den andre spilleren ved å ødelegge motstridende enheter. Assault-modus er en tidsbestemt to-spiller-kamp der en spiller forsøker å ødelegge den andre spillerens ressurser og festningsverk mens den andre forsvarer. Co-Op-modus er en utidsbestemt to-spiller-kamp der begge spillerne jobber sammen for å fullføre spesielle online-oppdrag som ikke er en del av enkeltspillerkampanjen. Frakoblet lokal flerspiller støttes ikke.