I CUBELLO, ved å bruke pekerfunksjonen til Wii-fjernkontrollen, sikter og skyter spillere fargede kuber mot et tredimensjonalt objekt kalt en Cubello, som i seg selv består av mange fargede kuber, som flyter og roterer i et tomt rom. Målet med spillet er å strippe Cubelloen for kuber ved å matche fire eller flere av samme farge for å avsløre Cabelloens indre kjerne. Spilleren får i utgangspunktet bare et begrenset antall kuber i et "magasin" for å fullføre målet i hvert trinn, men flere kuber legges til i magasinet til spilleren jo flere kuber de tar bort fra Cubello. Men i motsetning til mange andre spill, for eksempel Puzzle Bobble, hvor målet er å eliminere gjenstander med bestemte farger eller former, fortsetter Cabello å gi spilleren kubefarger som enten fortsatt er i magasinet eller på scenen, slik at spilleren må beregne for å få fargen til å forsvinne fra magasinet og scenen samtidig for å vinne. Det er også en "Bonus Mode" på spilleautomaten som gir spilleren ubegrensede kuber å skyte av én farge, eller "Super Bonus Mode" som gir kuber i forskjellige farger avhengig av hvor de lanseres. Du mister også kuber i magasinet hvis Cubelloen støter på skjermen mot deg. Spillet har en endeløs spillemodus i tillegg til at spillere går gjennom stadig vanskeligere stadier.