For evigheter siden bygde de gamle vismennene Temple of Time for å beskytte det hellige riket. Ganondorf, Gerudo-tyvenes konge, har oppnådd maktens trekraft og blitt ondskapens konge. Vismennenes kraft ligger i å sove i seks templer over Hyrule. Tiden er inne for deg å våkne som tidens helt! Denne tilpasningen tar Link til kjente steder og noen få nye. Det er designet for å være vanskeligere, mer tilgivende og mindre lineært enn vaniljespillet.