Mobile Suit Gundam: Gundam vs. Zeta Gundam finner sted syv år etter slutten av den ødeleggende ettårskrigen, med Titans politistyrke som overtar diktatoriske makter. Som A.E.U.G. opprørsgruppen sliter med å beseire Titans, heltene og skurkene i den originale Mobile Suit Gundam-serien befinner seg på samme side av denne nye konflikten. Du kan velge om du vil spille som medlem av A.E.U.G. eller Titans, og fest deg i en av 31 nye mobildresser. Øv på manøvreringsferdighetene dine i historiemodus for én spiller eller ta opp mot en venn i flerspillerkamper.