Banjo-Threeie er en ryktet tredje oppføring for Banjo-Kazooie-serien som visstnok var ment å bli laget for Nintendo GameCube på begynnelsen av 2000-tallet. Spillet ble først antydet på slutten av Banjo-Tooie, der karakteren Gruntilda spøkefullt sier "Bare vent til Banjo-Threeie...", som ble spekulert i å være bevis på at spillet på et tidspunkt var planlagt av fansen. På SpaceWorld 2000 ble en liten animasjon med karakterer fra Banjo-Kazooie-serien vist, som viste frem tilstedeværelsen av Rare under GameCube-æraen med spill. Animasjonen inneholder Banjo, Kazooie og Mumbo Jumbo som blir jaget av fiender fra Banjo-Tooie, som alle bruker modellene sine fra spillet. I 2002 ble Rare brakt av Microsoft, noe som fikk forskjellige spill utviklet for Nintendo-systemer på den tiden til å flytte plattformer, som ville ha inkludert Banjo-Threeie. Tiår senere, i 2020, bekreftet utvikleren Gregg Mayles at det rett og slett var en spøk som fansen tok for pålydende, og SpaceWorld-demoen ble bekreftet å ganske enkelt være et utstillingsvindu for hvor mange N64-modeller GameCube kunne gjengi på en gang. Ifølge Mayles var ikke et spill i samme stil som de to første i planene, og de gikk gjennom tre forskjellige konsepter, før de begynte på det som ble Banjo-Kazooie: Nuts & Bolts.