Med hovedrollen: A Boy and His Blob The Rescue of Princess Blobette forteller historien om en ung, mannlig hovedperson og hans blob-kamerat mens de forsøker å redde sistnevntes kjæreste, den titulære prinsesse Blobette. Jøken i nød har blitt fengslet av den antagonistiske alkymisten i det høyeste tårnet på det kongelige slottet på planeten Blobolinia. I likhet med forgjengeren, A Boy and His Blob: Trouble on Blobolonia, er The Rescue of Princess Blobette et puslespillplattformspill der spilleren direkte kontrollerer gutten mens han blir fulgt rundt av klatten, som styres av datamaskinens AI. Paret må navigere i de ulike passasjene og etasjene i slottet for å finne og frigjøre Blobette. Gutten kan bare løpe frem og tilbake, kan ikke hoppe eller svømme, og vil dø hvis han faller et langt stykke eller kommer i kontakt med farlige gjenstander som flammekastere og kloakkslanger. Blobben kan imidlertid gjøres til nyttige verktøy når han mates med gelébønner av forskjellige smaker. Hver smak forårsaker en annen transformasjon. For eksempel, å mate klatten med en mandaringelébønne vil forandre ham til en trampoline, som gutten deretter kan bruke for å nå høye plattformer. Spilleren kan også finne ekstra gelébønnesekker og mange valgfrie skatter. Å finne fem peppermynter vil øke spillerens ekstra liv med ett.