Basert på BurgerTime, Arcade-klassikeren fra 1982, setter BurgerTime Deluxe deg igjen i rollen som kokken Peter Pepper, en fyr som virkelig kan bygge en burger. Du manøvrerer kokken opp og ned stiger og venstre og høyre over etasjene for å gå over ulike deler av gigantiske hamburgere, for eksempel stor salat, store boller og massive kjøttkaker. Etter at du har krysset en hvilken som helst del av en hamburger, vil den falle ett nivå og skyve en hvilken som helst annen burgerdel i den stabelen nedover en etasje også. Hensikten med spillet er å bygge alle hamburgerne i hvert trinn ved å legge alle lagene til hver burger i fullførte stabler nederst på skjermen. Mens du driver med burgerbygging, vil matfiendene Mr. Pickle, Mr. Egg og Mr. Hot dog (også kjent som Frank N. Furter) jage etter deg. Du kan ødelegge disse kulinariske snittene ved å fange dem i fallende burgerdeler eller ved å lure dem til å gå på en burgerdel du er i ferd med å slippe. For å fryse matfiendene kan du strø en dash pepper på dem. Du begynner spillet med en liten pepperforsyning og kan plukke opp flere pepperbøsser som dukker opp gjennom nivåene. Du kan også hente bonuspoeng (i form av kopper og fat) og ekstra liv. I motsetning til den originale BurgerTime, som hadde mindre enn 10 forskjellige ikke-rullende skjermer, har BurgerTime Deluxe syv nivåer med fire trinn i hvert nivå for totalt 28 skjermer, hvorav de fleste ruller til en viss grad. En passordfunksjon lar deg gå tilbake til begynnelsen av siste nivå du spilte. Denne versjonen av spillet har også en konkurransemodus for to spillere (så lenge du har to kopier av spillet, en ekstra Game Boy og en linkkabel).