Du våkner opp på et mystisk sted og er vitne til en kamp mellom Arceus, Dialga, Palkia og Giratina. «Det må være et mareritt» tenker du. Hvor er du og hva skjer? Når drømmen tar slutt, ser det ut til at du er i huset ditt, men du får en melding om at professoren trenger din hjelp. Bare du kan det hemmelige språket til Alfa, et språk som din far har gitt videre. Det er den eneste nøkkelen til å løse problemet. Hadde den drømmen noen effekt på din verden? Skaff deg en Pokémon, reis verden rundt og lagre den før det er for sent!