Basert på forutsetningen om at gråt bidrar til å lindre stress, sikter Bandai Namco med «99 Tears» nettopp det, for å få Nintendo DS-eierne til å gråte. Spillet foregår i en by der innbyggerne har glemt hvordan de skal gråte. En dag, når du kommer tilbake fra jobb, løper du inn i en butikk som heter "Source of Tears", og historien begynner. Spilleren må spille på slutten av hver dag en av de 99 historiene som spillet har valgt for oss tidligere basert på en slags psykoanalyse. I følge responsen på historien vil spillet fortsette sekvensen optimalt for å provosere gråt.